Μετά το πέρασμά του χωρίς αγώνα από την α΄ φάση, ετοιμάζεται στη β΄ φάση να υποδεχθεί σε μονή αναμέτρηση στο δημοτικό γήπεδο Κομοτηνής την Κυριακή 8 Σεπτεμβρίου και ώρα 16:30, τον Κυπελλούχο της ΕΠΣ Χαλκιδικής, Α.Ο. Σάρτης.
Εφόσον, δε, προκριθεί, στη γ΄ φάση, θα αντιμετωπίσει, ξανά εντός έδρας και σε μονή επίσης αναμέτρηση, στις 14 Σεπτεμβρίου, τον νικητή του ζευγαριού Α.Ε. Κυδωνίας (Κυπελλούχος ΕΠΣ Χανίων) – Πανιώνιος (προβιβάστηκε στη Σούπερ Λιγκ 2). Δηλαδή πιθανότατα ο Πανθρακικός θα αντιμετωπίσει την επίσης ιστορική ομάδα του Πανιωνίου, δεκαέξι χρόνια μετά την πρώτη τους αναμέτρηση για τη Σούπερ Λιγκ (5/10/2018) όταν οι νεοφώτιστοι τότε γηπεδούχοι με τον Εμίλιο Φερέρα στον πάγκο τους πέτυχαν την παρθενική τους νίκη στην πρώτη τη τάξει κατηγορία, με τέρμα του Λουντοβίκ Κλεμάν στο 76ο λεπτό με απ΄ευθείας εκτέλεση φάουλ.
Ο μεγάλος τελικός της διοργάνωσης θα γίνει στις 27 Μαΐου 2025.
Εξάλλου, στις 22 Σεπτεμβρίου ξεκινά και το πρωτάθλημα της Γ΄ εθνικής, με τον Πανθρακικό να υποδέχεται στην Κομοτηνή τον ιστορικό Απόλλωνα Καλαμαριάς.
